Astana, Omonia, Helsinki, Noah, St. Gallen, Mlada Boleslav, Pafos, The New Saints, Olimpija Ljubljana, Cercle Brugge, Panathinaikos, Vikingur, Legia Varşova, Kopenhag, Vitoria Guimaraes, Celje, Djurgarden, Chelsea, Heidenheim, Larne, Real Betis ve Fiorentina, 2 maç sonunda tur atlayan ekipler oldu.
Rövanş karşılaşmalarının sonuçları şu şekilde:
Astana-Brann: 3-0
Zira-Omonia: 1-0
Trabzonspor-St. Gallen: 1-1 (Penaltılarda 4-5 St. Gallen)
Helsinki-Klasvik: 2-1
Ruzomberok-Noah: 3-1
Olimpija Ljubljana-Rijeka: 5-0
Paksi-Mlada Boleslav: 0-3
Pafos-Cluj: 3-0
The New Saints-Panevezys: 0-0
Cercle Brugge-Wisla Krakow: 1-4
Panathinaikos-Lens: 2-0
Santa Coloma-Vikingur: 0-0
Drita-Legia Varşova: 0-1
Kilmarnock-Kopenhag: 1-1
Zrinjski Mostar-Vitoria Guimaraes: 0-4
Celje-Pyunik: 4-1
Maribor-Djurgarden: 0-1
Servette-Chelsea: 2-1
Heidenheim-Hacken: 3-2
Puskas Akademia-Fiorentina: 1-1 (Penaltılarda 4-5 Fiorentina)
Larne-Lincoln Red Imps: 3-1
Real Betis-Kryvbas: 3-0